Trường PTDTBT THCS Nguyễn Trãi đặt tại thôn 5 xã Trà Tập, thành phố Đà nẵng. Phù hợp với quy hoạch phát triển giáo dục của địa phương. Trường được xây dựng trên diện tích đất 12.782,3 m² (theo Quyết định số 708/QĐ-UBND ngày 23/5/2019 của UBND huyện Nam Trà My, tỉnh Quảng Nam), với diện tích xây dựng là 2.010,97 m² và tổng diện tích sàn là 2.798,76 m².
Khuôn viên trường được quy hoạch khoa học, hài hòa giữa các hạng mục công trình và cây xanh. Công tác vệ sinh môi trường, chăm sóc cây cảnh được thực hiện thường xuyên, đảm bảo khuôn viên luôn xanh, sạch, đẹp và an toàn cho học sinh, cán bộ, giáo viên, nhân viên, đáp ứng tốt các yêu cầu tổ chức dạy học và hoạt động giáo dục .
Có kết cấu giao thông thuận lợi cho học sinh đi học, đáp ứng nhu cầu về phòng chống cháy nổ.
Tổng diện tích xây dựng trường, định mức diện tích sàn xây dựng các hạng mục công trình, các hạng mục công trình phục vụ trực tiếp cho các hoạt động dạy và tổ chức các hoạt động giáo dục
Trường được xây dựng trên khu đất có diện tích 12.782,3 m², đạt 34,45 m²/1 học sinh.
Diện tích xây dựng 2.010,97 m², tổng diện tích sàn 2.798,76 m² .
Trường gồm có 1 phòng Hiệu trưởng, 2 phòng Phó Hiệu trưởng, 1 văn phòng, 1 phòng tổ Khoa học Xã hội, 1 phòng tổ Khoa học Tự nhiên.
Trường có khu học tập 2 tầng với 09 phòng học và 1 phòng học ở khu 1 tầng đủ cho 10 lớp; có đủ các phòng bộ môn: Tiếng Anh – Âm nhạc, Tin học; Công nghệ, Khoa học tự nhiên, phòng thiết bị chung, phòng truyền thống, đoàn đội và thư viện. Khu bán trú học sinh bao gồm 17 phòng ở: 08 phòng nam và 09 phòng nữ. Nhà trường đã bố trí một nhà bếp nấu ăn và một nhà ăn cho học sinh. Nhà vệ sinh học sinh nội trú chia làm 2 khu cho học sinh nam và nữ. Ngoài ra nhà trường còn có khu nội trú giáo viên khang trang, rộng rãi đảm bảo cho đội ngũ giáo viên ăn ở và sinh hoạt.